기관계(器官系)는 생물학에서 특정 작업을 위해 함께 일하는 기관들을 하나로 묶은 것을 말한다. 순환계통, 호흡계통, 신경계통 등을 예로 들 수 있다. 기관계가 모여 유기체(또는 인체)를 이룬다.

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